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Utilisez des calculateurs d'admixture sur votre ordinateur

msamuel6
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fabriceroge ha scritto:
12 gennaio 2020, 13:28
Bonjour,

J'ai lancé hier le Tolan K71 sur le fichier de ma mère, a priori normande avec une branche picarde, et j'obtiens entre autres 1.14% sur 55-Amerindian.
23andme remontait aussi pendant un temps cette population avant de la faire disparaitre lors d'une mise a jour, j'ai donc pris ça pour une anomalie statistique ou quelque chose dans le genre.

J'ai une question: a quoi correspond réellement cette population? Qu'est ce qui peut expliquer qu'elle puisse apparaître chez une personne a priori 100% occidentale? Une erreur de séquençage est t'elle possible?
Pour ma part le tolan k71 m'a dit de grosses conneries.. Prenez l'option pro à 5€ vous aurez des oracles pour les calculateurs eurogene beaucoup plus fiable.

jerome4
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Il faut savoir maintenant que tous les calculateurs gedmatch (Eurogenes, MDLP, ect..) et les Tolan (K71 ect...) sont fiables qu'avec les anciens tests, et notamment la version V2 de 23andMe, qui n'existent plus depuis plusieurs années.
Avec les nouveaux tests, vous pouvez n'avoir que seulement 30% de SNPs nécéssaires à l'analyse.

Je ne sais pas si vous pouvez le voir dans le résultat via DNA studio, mais vous pouvez le savoir par exemple avec K36 sur gedmatch.
En bas de la page des résultats, vous avez le nombre de snps qui ont été utilisé pour l'analyse.
Le maximum pour ce calculateur est de 165 688 snps.
Faîtes le pourcentage de ce que vous avez, et vous aurez à peu près le même pourcentage dans n'importe lequel des calculateurs.

La différence dans les résultats peuvent être énorme pour une même personne!
Par exemple, mon père (V5 de 23andMe) a des résultats incohérent par rapport à moi, dans K36, parce qu'il lui manque 70% de SNPs dans l'analyse alors qu'avec mon test V2 de 23andMe, il me manque seulement 2%!

msamuel6
male
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jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 14:22
Il faut savoir maintenant que tous les calculateurs gedmatch (Eurogenes, MDLP, ect..) et les Tolan (K71 ect...) sont fiables qu'avec les anciens tests, et notamment la version V2 de 23andMe, qui n'existent plus depuis plusieurs années.
Avec les nouveaux tests, vous pouvez n'avoir que seulement 30% de SNPs nécéssaires à l'analyse.

Je ne sais pas si vous pouvez le voir dans le résultat via DNA studio, mais vous pouvez le savoir par exemple avec K36 sur gedmatch.
En bas de la page des résultats, vous avez le nombre de snps qui ont été utilisé pour l'analyse.
Le maximum pour ce calculateur est de 165 688 snps.
Faîtes le pourcentage de ce que vous avez, et vous aurez à peu près le même pourcentage dans n'importe lequel des calculateurs.

La différence dans les résultats peuvent être énorme pour une même personne!
Par exemple, mon père (V5 de 23andMe) a des résultats incohérent par rapport à moi, dans K36, parce qu'il lui manque 70% de SNPs dans l'analyse alors qu'avec mon test V2 de 23andMe, il me manque seulement 2%!
Cela veut dire que le génotype ratio ( la par exemple 98.82% sur mes résultats k36) peuvent être aussi des indices de fiabilité ? Et que pensez vous de l'oracle ancien de gedmatch k36 ?
image.png

jerome4
male
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msamuel6 ha scritto:
12 gennaio 2020, 18:40
jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 14:22
Il faut savoir maintenant que tous les calculateurs gedmatch (Eurogenes, MDLP, ect..) et les Tolan (K71 ect...) sont fiables qu'avec les anciens tests, et notamment la version V2 de 23andMe, qui n'existent plus depuis plusieurs années.
Avec les nouveaux tests, vous pouvez n'avoir que seulement 30% de SNPs nécéssaires à l'analyse.

Je ne sais pas si vous pouvez le voir dans le résultat via DNA studio, mais vous pouvez le savoir par exemple avec K36 sur gedmatch.
En bas de la page des résultats, vous avez le nombre de snps qui ont été utilisé pour l'analyse.
Le maximum pour ce calculateur est de 165 688 snps.
Faîtes le pourcentage de ce que vous avez, et vous aurez à peu près le même pourcentage dans n'importe lequel des calculateurs.

La différence dans les résultats peuvent être énorme pour une même personne!
Par exemple, mon père (V5 de 23andMe) a des résultats incohérent par rapport à moi, dans K36, parce qu'il lui manque 70% de SNPs dans l'analyse alors qu'avec mon test V2 de 23andMe, il me manque seulement 2%!
Cela veut dire que le génotype ratio ( la par exemple 98.82% sur mes résultats k36) peuvent être aussi des indices de fiabilité ? Et que pensez vous de l'oracle ancien de gedmatch k36 ? image.png
C'est sans doute un test fait il y a longtemps?
A moins que ce soit FTDNA?

Pour l'oracle ancien, il faudrait mettre des anciens que de la même époque.
Sinon, comment voulez-vous interpréter les résultats?

msamuel6
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jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 19:04
msamuel6 ha scritto:
12 gennaio 2020, 18:40
jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 14:22
Il faut savoir maintenant que tous les calculateurs gedmatch (Eurogenes, MDLP, ect..) et les Tolan (K71 ect...) sont fiables qu'avec les anciens tests, et notamment la version V2 de 23andMe, qui n'existent plus depuis plusieurs années.
Avec les nouveaux tests, vous pouvez n'avoir que seulement 30% de SNPs nécéssaires à l'analyse.

Je ne sais pas si vous pouvez le voir dans le résultat via DNA studio, mais vous pouvez le savoir par exemple avec K36 sur gedmatch.
En bas de la page des résultats, vous avez le nombre de snps qui ont été utilisé pour l'analyse.
Le maximum pour ce calculateur est de 165 688 snps.
Faîtes le pourcentage de ce que vous avez, et vous aurez à peu près le même pourcentage dans n'importe lequel des calculateurs.

La différence dans les résultats peuvent être énorme pour une même personne!
Par exemple, mon père (V5 de 23andMe) a des résultats incohérent par rapport à moi, dans K36, parce qu'il lui manque 70% de SNPs dans l'analyse alors qu'avec mon test V2 de 23andMe, il me manque seulement 2%!
Cela veut dire que le génotype ratio ( la par exemple 98.82% sur mes résultats k36) peuvent être aussi des indices de fiabilité ? Et que pensez vous de l'oracle ancien de gedmatch k36 ? image.png
C'est sans doute un test fait il y a longtemps?
A moins que ce soit FTDNA?

Pour l'oracle ancien, il faudrait mettre des anciens que de la même époque.
Sinon, comment voulez-vous interpréter les résultats?
Oui c'est un test ftdna et oui c'est clair que de comparer avec des pop des différentes époques c'est pas top mais sur le admixture studio pro je constate néanmoins des améliorations car sur l'oracle normal ou sur yourdnaportal ma population majoritaire était pannonian alors que cela correspond à la Hongrie ce qui est pas trop réaliste vue mes résultats k36 alors que les mycéniens pourrait correspondre à un mélange entre mon cluser italian, east med , east Balkan ou même arabian ou armenian.

msamuel6
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jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 19:04
msamuel6 ha scritto:
12 gennaio 2020, 18:40
Cela veut dire que le génotype ratio ( la par exemple 98.82% sur mes résultats k36) peuvent être aussi des indices de fiabilité ? Et que pensez vous de l'oracle ancien de gedmatch k36 ? image.png
C'est sans doute un test fait il y a longtemps?
A moins que ce soit FTDNA?

Pour l'oracle ancien, il faudrait mettre des anciens que de la même époque.
Sinon, comment voulez-vous interpréter les résultats?
Avez vous des informations sur les pop utilisés pour établir l'oracle du calculateur k47 sur Admixture studio ?

jerome4
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msamuel6 ha scritto:
13 gennaio 2020, 09:55
jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 19:04
msamuel6 ha scritto:
12 gennaio 2020, 18:40
Cela veut dire que le génotype ratio ( la par exemple 98.82% sur mes résultats k36) peuvent être aussi des indices de fiabilité ? Et que pensez vous de l'oracle ancien de gedmatch k36 ? image.png
C'est sans doute un test fait il y a longtemps?
A moins que ce soit FTDNA?

Pour l'oracle ancien, il faudrait mettre des anciens que de la même époque.
Sinon, comment voulez-vous interpréter les résultats?
Avez vous des informations sur les pop utilisés pour établir l'oracle du calculateur k47 sur Admixture studio ?
Non!

msamuel6
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jerome4 ha scritto:
13 gennaio 2020, 10:26
msamuel6 ha scritto:
13 gennaio 2020, 09:55
jerome4 ha scritto:
12 gennaio 2020, 19:04


C'est sans doute un test fait il y a longtemps?
A moins que ce soit FTDNA?

Pour l'oracle ancien, il faudrait mettre des anciens que de la même époque.
Sinon, comment voulez-vous interpréter les résultats?
Avez vous des informations sur les pop utilisés pour établir l'oracle du calculateur k47 sur Admixture studio ?
Non!
Désolé de vous avoir dérangé !

deheegeschmeltz
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msamuel6 ha scritto:
07 gennaio 2020, 22:01
deheegeschmeltz ha scritto:
07 gennaio 2020, 14:34
Désolée, le message est parti trop tôt :D

Je voulais ajouter qu'aucun des ces onglets n'a fait planter mon ordinateur, mais j'ai dû biaiser en installant une nouvelle version de Chrome pour m'en débarrasser.

Avez- vous rencontré ce type de problème avec une version antérieure d'Admixture Studio ?
Bonjour à tous,

Un petit tour par ici pour vous dire que j'en suis toujours au même point avec Admixture Studio…. Je dispose de l'application Norton, comme sans doute certains d'entre vous. Impossible de télécharger la dernière version V2.4; j'ai aussitôt un message de l'anti-virus m'indiquant qu'une menace a été détectée et que le fichier a été éliminé (menace sans doute réelle, comme je l'avais dit plus haut, j'avais vu apparaître des onglets commerciaux avec des sites US stockés dans ma barre de recherche, impossibles à éliminer sans recourir à une réinstallation de Chrome. j
J'ai fait le test avec Google, même, souci.

Vous semblez utiliser sans problème ces calculatrices, quelle est la recette miracle ;) :lol:

(Mon niveau de protection Norton comporte simplement une extension Navigation Web et je n'ai jamais eu de problème avec des sites comme Gedmatch ou d'autres sites visités comme DNA land, Living DNA...)

Merci à tous

jpfois
jpfois
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Vous semblez utiliser sans problème ces calculatrices, quelle est la recette miracle ;) :lol:
On évite d’utiliser Norton ! :lol:
50 % sarde du coté paternel (commune de Bultei) et 50 % espagnol du coté maternel (commune de Aledo) mais 100 % français ! - Haplogroupe: J2a1b-M67


deheegeschmeltz
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Effectivement :D mais les fichiers parasites adorent se prélasser sur la barre d'écran. Sortir de nouveau l'artillerie lourde pour les déloger ? :lol:


deheegeschmeltz
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Merci pour votre réponse. Mon interrogation est en limite de sujet, c'est vrai, mais je suis terriblement néophyte en la matière. J'avais déjà repéré ces parades à mettre en oeuvre hier en consultant les paramètres avancés. A tester.

Bien cordialement

poulduwic
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bonjour

je n'utilise pas Norton mais un autre un peu plus efficace et qui m'a aussi signalé que ce site était vérolé ... ☢
perso je m'abstiens d'y retourner :roll:

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